
2024年9月由沈阳现代农业本科大学张万刚先生团对在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物体为该研究提供了亚硝基化呈现组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
英文版微信标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
论文期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202四年作用成分:5.7
先生发表时间间隔:2024年9月
的客户机构:南京农业大学
科研的原材料:蛋白
拜谱供给技術:亚硝基化修饰组学
技术工艺路线地图:
一、研发最终结果
01.Caspase-3活性酶
现尚不知晓NO对caspase-3的遏制成用要不要归因于NO介导的S-亚硝基化,差异浓度值系数的GSNO最为外源性NO提供,以成脂caspase-3的休外S-亚硝基化。结论意味着,与不存在GSNO的组比较,100、200和400μM GSNO组的caspase-3渗透性重要变低(图1),与原先了解共同。GSNO正确处理变低caspase-3渗透性的潜在性理由仍亟需阐述。
图1 有差异 酸度的GSNO进行处理对caspase-3活力的的影响
02.Caspase-3的S-亚硝基化状态
科学科学研究分析Caspase-3的亚硝基化的情况,以体现了GSNO对Caspase-3的反映性。经GSNO清理后,探测到caspase-3蛋白酶S-亚硝基化难度提升(图2)。哪些毕竟认为,外源性GSNO陪养可成就 诱骗caspase-3的身体外S-亚硝基化。最让人咋舌的是,在还没有GSNO现实存在的對照组中探测到另一个暗淡的S-亚硝基化带,这认为caspase-3也许 發生内源性的S-亚硝基化。于此,本科学科学研究分析中caspase-3的S-亚硝基化的情况较高,而caspase-3的可溶性减低,这与此前的科学科学研究分析一致性。可是,caspase-3的特喜欢的人S-亚硝基化修饰语位点尚不清理,还需求进步骤的打磨。
图2 GSNO进行处理对caspase-3S-亚硝基化技术水平的应响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化淡化组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。海蓝标签的队列表明S-亚硝基化肽,红标签的C表明S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3可降解结淀粉酶
结球血清作为一个这种重点的细胞膜系骨架球血清,在达到肌细胞膜系成分的成分完正性和缩小性角度起着重于点功效,实验S-亚硝基化caspase-3对结球血清光降解塑料的比较渗透性状态体现了重点有何意义。与Std(未用胱天球血清酶-3和GSNO孵育的初始状态肌弹性纤维素球血清)组相较于,0 μM GSNO组(肌原弹性纤维素和caspase-3的孵育,无GSNO)的完正结球血清占比特殊拉低,建议caspase-3对结球血清体现了风险的球血清蛋清质水解平均水平。在GSNO孵育后,完正结球血清的占比看不出提高(P < 0.05)。除外,当GSNO氨水浓度提高时,完正结球血清的占比定期调涨(P < 0.05)(图5)。某些发觉认为,SNO体现的caspase-3以平均水平根据的原则治理和改善结球血清的光降解塑料。
图5.S-亚硝基化caspase-3溶解结蛋白质
05.S-亚硝基化Caspase- 3光降解肌钙核蛋白-T
肌钙蛋清-T (TnT)是原肌球蛋清转换负责管理背部肌肉回缩的细细的的也要肌原食物玻璃玻纤蛋清。TnT的化学化学分解塑料塑料特性是查测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化條件下,caspase-3对TnT的化学化学分解塑料塑料的情况右图6如下图所示,与Std组(不含有caspase-3和GSNO的肌原食物玻璃玻纤)比较,caspase-3组中30 kDa TnT段落同质性曾加,说明caspase-3加入了TnT的化学化学分解塑料塑料,凡此种种,caspase-3与GSNO的孵育造成的30 kDa TnT骤降。在100和200 μM GSNO组互相不会查测到比较突出的对比(P > 0.05),而当GSNO的盐浓度可达400 μM 时,该段落同质性极大减少(P < 0.05)。哪些得知说明了SNO遮盖的caspase-3对TnT化学化学分解塑料塑料的可抑自制用。结蛋清和TnT是caspase-3的灵敏底物,而GSNO操作降底caspase-3的化学活化机会造成的肌原食物玻璃玻纤蛋清化学化学分解塑料塑料的情况降底。上面所讲,NO诱导性的S-亚硝基化应该依据遮盖半胱氨酸残基来转换caspase-3的化学活化,于是进两步的影响到其对结蛋清和TnT的蛋清淀粉水解力,最后的影响到牛肉片好品质。
图6. S-亚硝基化caspase- 3生物降解肌钙血清-T
二、工作小结
本探析广泛宣传论述S-亚硝基化对caspase-3装饰语的应响到还有其随着对鸡肉肌原食物食物纤维身体分解的应响到。球球蛋白酶S-亚硝基化都可以装饰语caspase-3的半胱氨酸残基,才能使得caspase-3抗逆性下降,进一点抑止了其对鸡肉肌原食物食物纤维球球蛋白酶的球球蛋白酶蛋白质水解性能。三、拜谱总结ppt
探究应用了酶活法测,亚硝基化呈现组学解析,WB等论文检测措施,出现球淀粉酶S-亚硝基化是可以呈现caspase-3的半胱氨酸残基,这引发了caspase-3化学活化的缩减,相结两步阻止了其对牛羊肉肌原弹性纤维球淀粉酶的球淀粉酶溶解的能力。本探究为解釋球淀粉酶质亚硝基化对口感的调空制度化带来了了一大个新的移动镜头。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的球营养素组学、遮盖球营养素组学、分泌组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸物料物料,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total氧化反应展现、解离巯基,欢迎大家咨询!
考生医学文献:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663